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子结构检索中关系数据库插件的使用和效率
王玉玲; 吴昊; 温浩
2011
Source Publication计算机与应用化学
Issue11Pages:1419-1423
Abstract采用关系数据库插件能够实现化合物描述符(FingerPrint)的生成、建立索引和化合物的子结构检索。本文以PubChem有机化合物Molfile为数据源,在Oracle关系数据库上分别安装插件OrChem(JAVA)和Bingo(C~(++))构建了化合物分子结构数据库。本文从FingerPrint的构成和索引策略两方面讨论了OrChem和Bingo的主要差异,并选取10个特征化合物进行子结构检索测试。对存储40万种化合物的分子结构数据库的测试结果显示,OrChem可满足用户检索响应,Bingo则更为快捷。对于存储2600万种化合物的分子结构数据库,针对Bingo通过优化Oracle数据库内存管理、数据表结构、子结构预筛选参数,实现了满足用户的高效检索。
Keyword分子结构数据库子结构检索 关系数据库插件 预筛选
Document Type期刊论文
Version出版稿
Identifierhttp://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/10499
Collection研究所(批量导入)
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GB/T 7714
王玉玲,吴昊,温浩. 子结构检索中关系数据库插件的使用和效率[J]. 计算机与应用化学,2011(11):1419-1423.
APA 王玉玲,吴昊,&温浩.(2011).子结构检索中关系数据库插件的使用和效率.计算机与应用化学(11),1419-1423.
MLA 王玉玲,et al."子结构检索中关系数据库插件的使用和效率".计算机与应用化学 .11(2011):1419-1423.
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子结构检索中关系数据库插件的使用和效率_(482KB) 限制开放CC BY-NC-SAApplication Full Text
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