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分子动力学模拟软件GROMACS向GPGPU移植初探
严历; 郭力; 李晓霞
2010
Source Publication计算机与应用化学
Issue12Pages:1603-1606
AbstractGROMACS是著名分子动力学模拟软件之一,GPGPU技术能够使用图形处理器完成通用计算,是高性能计算的最新发展趋势。本文通过对Nvidia CUDA GPGPU编程模式以及GROMACS代码的研究分析,论证了将GROMACS移植到以GPGPU为计算核心的平台上的可行性,并通过算法和参数数据组织形式的改造实现了GROMACS中非键力计算函数从x86处理器向GPGPU的移植,获得显著的性能提升,计算加速比达到10倍以上,为GROMACS整体移植的实现奠定了基础。
Keyword分子动力学 Gromacs Gpgpu Cuda
Indexed ByCSCD
CSCD IDCSCD:4082604
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Cited Times:1[CSCD]   [CSCD Record]
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.ipe.ac.cn/handle/122111/10616
Collection研究所(批量导入)
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GB/T 7714
严历,郭力,李晓霞. 分子动力学模拟软件GROMACS向GPGPU移植初探[J]. 计算机与应用化学,2010(12):1603-1606.
APA 严历,郭力,&李晓霞.(2010).分子动力学模拟软件GROMACS向GPGPU移植初探.计算机与应用化学(12),1603-1606.
MLA 严历,et al."分子动力学模拟软件GROMACS向GPGPU移植初探".计算机与应用化学 .12(2010):1603-1606.
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分子动力学模拟软件GROMACS向GPG(731KB)期刊论文出版稿限制开放CC BY-NC-SAApplication Full Text
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